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Abteilungen > Klinische Mikrobiologie: Info
Struktur und Ausrichtung
Wir sind auf die Diagnostik von Infektionskrankheiten durch Bakterien und Pilze spezialisiert. Unsere Dienstleistungen erstrecken sich auf die Fachgebiete Bakteriologie, Mykobakteriologie, Mykologie, molekulare Diagnostik, Infektionsserologie und spitalhygienische Untersuchungen.
Diese bieten wir Spitälern, Diagnostik- und Behandlungszentren, Arztpraxen und anderen Labors an. Unser Team von 30 qualifizierten MitarbeiterInnen verarbeitet rund 60'000 Untersuchungsmaterialien pro Jahr.
Dienstleistungsangebot
Formulare
 Mikrobiologie (2)
Infektionsserologie (14)
Öffnungszeiten
Montag-Freitag: 8.00 – 18.00 h
Samstag: 8.00 – 12.00 h
Sonntag: 8.00 – 12.00 h
Fachspezifische Beratung
 Fachverantwortliche Klinische Mikrobiologie
Fachliche Schwerpunkte
- Bakteriologie
Aus verschiedensten Untersuchungsmaterialen (Blut, Urin, Stuhl, Abstriche, Sekrete, Punktate und Gewebe) werden mikroskopisch und in Kulturen bakterielle Infekterreger nachgewiesen. Zum raschen Nachweis von Bakterien und Pilzen im Blut steht ein automatisiertes Blutkultursystem (BacT/ALERT) zur Verfügung. Um dem Arzt und der Ärztin eine gezielte Antibiotikatherapie zu ermöglichen und die Resistenzsituation zu überwachen, testen wir die Empfindlichkeit der isolierten Erreger routinemässig auf bis zu 28 Antibiotika. Auf Anforderung kann die minimale Hemmkonzentration (MHK) von 40 antimikrobiellen Substanzen bestimmt werden.
Je nach Fragestellung bieten wir spezielle Kulturen auf folgende Erreger bzw. Erregergruppen an:
- anaerobe Bakterien
- Aeromonas, Plesiomonas
- Campylobacter jejuni und coli
- Clostridium difficile (inkl. Nachweis von Toxin A und B)
- Corynebacterium diphtheriae
- Legionellen
- Mycoplasma hominis, Ureaplasma urealyticum
- Neisseria gonorrhoeae
- Streptococcus agalactiae (Gruppe-B-Streptokokken), selektive Anreicherung
- Vibrio cholerae und andere Vibrio spp.
- Yersinien
- Mykobakteriologie
- Kulturnachweis von tuberkulösen und nichttuberkulösen Mykobakterien
- Direkte Fluoreszenzmikroskopie nach Auramin-Rhodamin-Färbung
- PCR-Nachweis von Mycobacterium tuberculosis-Komplex
- Schneller Kulturnachweis mittels CO2-Messung in automatisiertem System
- Schnellidentifikation von Kulturen mittels 17 Gensonden
- Identifikation von Kulturen durch Sequenzierung des 16S rRNA-Gens
- Schnelle radiometrische Resistenztestung auf INH, Rifampicin, Ethambutol, Pyrazinamid und Streptomycin
- Mykologie
Kulturnachweis von medizinisch relevanten
- Sprosspilzen (Hefen)
- Schimmelpilzen
- dimorphen Pilzen (Histoplasma, Blastomyces und (Para-)Coccidioides)
- Malassezia furfur.
- Quantitativer Antigennachweis von Cryptococcus neoformans aus Liquor und Serum
- Resistenzprüfung von Hefen auf 8 antifungale Substanzen (MHK)
- Molekulare Diagnostik
- Nachweis aus klinischen Proben mittels PCR:
- Chlamydia trachomatis
- Neisseria gonorrhoeae
- Mycobacterium tuberculosis-Komplex
- Nachweis von Virulenz- und Resistenzgenen ab Kultur mittels PCR bei Staphylokokken:
- Oxacillin-Resistenzgen (mecA-Gen)
- Gen für toxisches Schocksyndrom-Toxin (TSST-1)
- Gene für Enterotoxine A, B, C, D und E
- Gene für Exfoliatine A und B
- • Gene für Panton-Valentine-Leukocidin (PVL)
- Bei Enterokokken:
- Vancomycin-Resistenzgene (vanA, vanB, vanC-1 und vanC-2/3)
- Identifikation ab Kultur:
- Sequenzierung des 16S rRNA-Gens: alle Bakterien
- PCR: Staphylococcus aureus, Enterococcus faecalis, E. faecium, E. gallinarum und E. casseliflavus
- Hybridisierung mit Gensonden: tuberkulöse und nichttuberkulöse Mykobakterien
- Infektionsserololgie
In Zusammenarbeit mit dem Chemielabor bieten wir täglich zur Zeit folgende Antikörper- und Antigen-Nachweise an
- Hepatitis A-Antikörper gesamt und IgM
- Hepatits B
- HBs-Antigen
- HBs-Antikörper quantitativ
- HBc-Antikörper gesamt und IgM
- HBe-Antigen
- HBe-Antikörper
- Hepatits C Antikörper
- HIV-Screeningtest (p24 Antigen und HIV-Antikörper)
- Toxoplasmose IgG- und IgM-Antikörper
- Cytomegalievirus (CMV) IgG- und IgM-Antikörper
- Rubella IgG- und IgM-Antikörper
- Treponema pallidum Antikörper (Syphilis Screening, TPPA)
- Pneumokokken- und Legionella-pneumophila-Antigen (Serogruppe 1) aus Urin
- Spitalhygienische Untersuchungen
- Screening auf Staphylococcus aureus und MRSA
- Screening auf ESBL-produzierende Enterobakteriazeen
- Stuhluntersuchungen bei Küchenpersonal
- Auswertung von Luftkeimmessungen
- Hygienische Kontrollen der Endoskopaufbereitung
- Mikrobiologische Kontrollen von Autoklaven
- Molekulare Typisierung von nosokomialen Erregern mittels Puls-Feld-Gel-Elektrophorese (PFGE), PCR-basierenden Verfahren und Plasmidanalyse
- Molekulare Typisierung von S. aureus mittels sequenzbasiertem spa-Typing
- Antibiotikaresistenzen
Auswertung der im Mikrobiologielabor Universitätsspital Basel durchgeführten Routineresistenzprüfungen.
Qualitätskontrolle
Das Mikrobiologielabor ist vom Bundesamt für Gesundheit (BAG) anerkannt.
Das Qualitätssicherungssystem des Mikrobiologielabors ist von SWISSMEDIC zertifiziert nach Good Laboratory Practice (GLP).
Wir nehmen an folgenden externen Qualitätskontrollen teil:
- UK NEQAS Quality Assurance Laboratory, London
- Bakteriologie
- Mykobakteriologie
- Mykologie
- PCR Chlamydia trachomatis
- Institut für Medizinische Mikrobiologie der Universität Zürich
- Nationales Zentrum für Mykobakterien, Zürich
- Quality Control for Molecular Diagnostics, Glasgow, UK
- PCR Mycobacterium tuberculosis-Komplex
- CSCQ Schweizerisches Zentrum für Qualitätskontrolle, Chêne-Bourg
- BSD SRK Blutspendedienst SRK, Bern
Forschung, Entwicklung und Lehre
Schwerpunkte in Forschung und Entwicklung sind die Erfassung von nosokomialen Infekterregern und Antibiotikaresistenzen. Mit der Klinik für Infektiologie und Spitalhygiene des Universitätspitals Basel besteht eine enge Zusammenarbeit.
Aus- Weiter- und Fortbildung
Ausbildung medizinischer LaborantInnen SRK
Schwerpunkte in Forschung und Entwicklung sind die Erfassung von nosokomialen Infekterregern und Antibiotikaresistenzen. Mit der Klinik für Infektiologie und Spitalhygiene des Universitätspitals Basel besteht eine enge Zusammenarbeit.
Weiterbildung FAMH
Für die Weiterbildung zur SpezialistIn für medizinisch-mikrobiologische Analytik FAMH bieten wir einen Arbeitsplatz an.
Vorlesungstätigkeit
Der Laborleiter ist Lehrbeauftragter für Bakteriologie an der medizinischen Fakultät der Universität Basel.
Fortbildung
Labormedizin > Weiterbildung
Analysen-Tarife
Tarife der Analysen der Abteilung Klinische Mikrobiologie
Links
Einführung in die klinische Bakteriologie: Taxonomie, grundlegende Labortechniken (University of Texas, USA)
medic.med.uth.tmc.edu/path/00001450.htm
Lehrbuch über medizinische Mikrobiologie: Medical Microbiology Book (University of Texas Medical Branch, USA)
gsbs.utmb.edu/microbook/toc.htm
Foodborne Pathogenic Microorganisms: "Bad Bug Book" (FDA u.a., USA)
vm.cfsan.fda.gov/~mow/intro.html
Gram Stain (Loyola University Health System, Chicago, USA)
www.lumen.luc.edu/lumen/DeptWebs/microbio/med/gram/gram-stn.htm
Photo Gallery of Bacterial Pathogens (Links)
www.geocities.com/CapeCanaveral/3504/gallery.htm
Bakterien-Toxonomy:
List of Prokaryotic Names with Standing in Nomenclature (France)
www.bacterio.cict.fr
Mykologie: Dr. Fungus, USA
www.doctorfungus.org/index.htm
Mycology Online (The University of Adelaide, Australia)
www.mycology.adelaide.edu.au
Links Pertaining to Bacterial Infections and Mycoses (Karolinska Institutet, Schweden)
www.mic.ki.se/Diseases/C01.html
Klinik für Infektiologie, Universitätsspital Basel
www.infektiologie.uhbs.ch
Abteilung für Spitalhygiene, Universitätsspital Basel
www.spitalhygiene.ch/Html/index.htm
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